В какой форме предоставляются налоговые вычеты?

Добрый день! Подскажите, пожалуйста, в какой форме предоставляются налоговые вычеты? 
Для доходов, в отношении которых предусмотрена налоговая ставка 13%, налоговая база подлежит уменьшению на сумму следующих налоговых вычетов: 1) стандартные (ст. 218 НК РФ); 2) социальные (ст. 219 НК РФ); 3) имущественные (ст. 220 НК РФ); 4) профессиональные (ст. 221 НК РФ); 5) инвестиционные (ст. 219.1 НК РФ).
Данные вычеты уменьшают налоговую базу на сумму вычета? Т.е. мы из суммы з.п отнимаем вычет, а затем уменьшаем на процентную ставку? Если да, то по всем ли видам вычетов действует такая система?